یکی از ظرفیت های خوب و مهم موسسه مذاهب اسلامی استفاده از دانش پژوهان و فارغ التحصیلان متخصص مذاهب در امر تبلیغ می باشد. موسسه مذاهب اسلامی در ایام و مناسبت های مختلف ملی و مذهبی مانند:ماه مبارک رمضان، دهه غدیر و دهه اول محرم، دهه آخر صفر، هفته وحدت و فاطمیه اول و دوم و ایام دهه فجر اقدام به حمایت از مبلغین متخصصی می کند که به تبیلغ در مناطق قومی مانند استانهای کردستان، آذربایجان غربی،آذربایجان شرقی، کرمانشاه، گلستان، خراسان شمالی، خراسان جنوبی، خراسان رضوی، فارس، سیستان و بلوچستان، هرمزگان و بندرعباس مشغول بوده اند.
این مبلغین بیش از 200 نفر می باشند و بعد از هر تبلیغ گزارش تبلیغی خود را به واحد تبلیغ موسسه ارسال می کنند.